No modelo de parceria público-privada (PPP) oferecido pelo Governo do Estado de São Paulo, o HRSJC conta com duas entes administrativas, realizadas em total sintonia: o Instituto Sócrates Guanaes (ISG) e a Inova Saúde S/A.

O Instituto Sócrates Guanaes é uma organização civil de direito privado, sem fins lucrativos, que tem como missão promover saúde com espírito público e eficiência do privado. Fundado em 13 de julho de 2000 em Salvador, Bahia, foi reconhecido como de utilidade pública municipal e estadual e qualificado como Organização Social de Saúde. Referência na formação médica e multiprofissional de terapia intensiva, é um dos pioneiros no tratamento humanizado em ambiente hospitalar.

A Inova Saúde S/A é uma Sociedade com Propósito Específico (SPE), fundada em 2014, que oferece equipamentos, manutenção e gestão dos serviços não assistenciais, entre eles limpeza e higienização hospitalar, controle de acesso e segurança, alimentação e nutrição de pacientes, lavanderia hospitalar, manutenção de infraestrutura, engenharia clínica, Tecnologia de Informação, Central de Material Esterilizado, Logística de suprimentos hospitalares.